マイフォルダはユーザー毎に割り当てられたディレクトリで、割当容量の許す限り自由に使うことができます。
管理者から割り当てられたフォルダーで、ユーザー間で共有されます。
ゲストフォルダでは、ユーザー以外の人(例えば取引先の担当者)とフォルダーを共有することが出来ます。ゲストとしてログインすると専用フォルダー以外の情報は見えなくなるので、必要な情報だけをシステム外の人と共有することができます。